每年的5月至7月是孢子虫病暴发期，尤其是鲫鱼死亡率非常高，可达90%以上，给很多养殖户带来重大经济损失。

有的孢子虫寄生在鱼鳃上、有的寄生在鱼皮肤上、有的寄生在鱼鳍条上及肠道里。常见的有饼形碘孢虫、野鲤碘孢虫、鲫鱼碘孢虫、鲢碘孢虫，引发的症状是病鱼身体发黑、离群独游、打转、眼球突出、鳍条上有球状孢子。

发病池塘每亩水深1米可用20毫升孢子虫清每天泼洒一次（注意天阴、缺氧情况下不能用药），连续用药2—3天，同时每40公斤饲料拌100克孢虫静内服，连服5至6天，可有效防治孢子虫病。